Качество биотоплива определяет дальнейшее развитие заводов по производству биоэнергии в том числе пеллет, а также ценообразование и технологии утилизации отходов. Согласно Европейскому комитету по стандартизации (ЕКС), который сейчас работает по новым топливным стандартам, выделяют три основных вида биотоплива: Чистая биомасса (в ее состав входят чистая древесина и другое биосырье); Биомасса, содержащая примеси (в соответствии с требованиями, установленными Евросоюзом и Норвежским Правительством, данный вид топлива может использоваться только после сжигания (окисления) непригодных примесей); Биомасса, содержащая вредные примеси (это пропитанная, например смолой или антисептиками, древесина, использование которой возможно только после применения специальных технологий окисления и очистки).
Определенные сложности возникают из-за того, что у разных поставщиков качество твердого биотоплива значительно отличается. Для получения доверия потребителей, твердое биотопливо должно иметь определенные гарантии качества, основанные на четко установленных стандартах. Это, прежде всего, стандарты качества биологического топлива Международного/ Европейского образца.
